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Publications


- 2016 -


Microccopía Confocal, FRAP, FRET
Härtel S.
Curso Postgrado Biología Molecular para Biomedicina 2015. Santiago, Chile. Mayo 19 del 2016


Fotones que van y fotones que vienen: Una ventana al sorprendente viaje al micromundo virtual Härtel S.
Härtel S.
Escuela de Temporada Magallanes Magallanes, Chile. Enero 1 del 2016


Optics, Forces and Development
Härtel S.
INTERNATIONAL COURSE AND WORKSHOP. Santiago, Chile. Marzo 14 del 2016


Processing and Analysis of Fluorescence Microscopy Images
Härtel S.
Institut Pateur de Montevideo. Montevideo, Uruguay. Marzo 29 del 2016.


4-Lens Light Sheet Fluorescence Microscopy: Ventana hacia una nueva escala espacio temporal para la investigación biomédica en Chile
Härtel S.
Núcleo de Óptica Avanzada. Santiago, Chile. Enero 5 del 2016


Sistema de Conteo Espermático e Informe Médico Remoto con Alcance Nacional
Härtel S.
¨Seminario de Ingeniería Biomédica¨ y ¨Curso Informática Médica¨ Montevideo, Uruguay. Marzo 5 de 2016


Microscopía Confocal y Análisis de Imágenes Aplicados a la Microbiología
Härtel S.
Curso de Postgrado PEDECIBA-Biología. Montevideo, Uruguay. Junio 22 de 2016


- 2015 -


Magíster en Informática Médica
Härtel S.
Decanato de la Facultad de Medicina. Santiago Chile. Enero 1 de 2015


Nuevas Oportunidades de Desarrollo Abiertas por Red Fotónica de Fibra Optica Austral
Härtel S. y García A.
Jornada Tecnológica de Magallanes, Punta Arenas, Chile. Enero 27 de 2015


Nuevas Oportunidades de Desarrollo Abiertas PPR Red Fotónica de Fibra Optica Austral
Härtel S.
Jornada Tecnológica de Aysén, Coyhaique, Chile, Enero, 30 de 2015


Advanced Imaging and Data Integration, SCIAN-Lab, BNI, F-Med, U-Chile.
Härtel S.
STIC-AMSUD: ReRISiP, Maceio, Brasil. Abril 7 de 2015


Advanced Imaging and Remote Biomedical Image Analysis
Härtel S.
Defensa de Tesis de Doctorado. Montevideo Uruguay. Mayo 26 de 2015


Conference on Applied Immunohistochemistry
Härtel S.
2nd NordiQC Conference on Applied Immunohistochemistry. Aalborg Dinamarca. Junio 9-12 de 2015


Reuniones: En el TIGA Center
Härtel S.
Tissue Imaging and Analysis Center. Heidelberg, Alemania. Junio 15 de 2015


BNI BioMat: Laboratory for Scientific Image Analysis
Härtel S.
Junio 30 de 2015


Extensión de Aplicaciones Interoperabilidad
Härtel S.
Demostración de desarrollo sobre la plataforma de ehCOS HDK para sistemas de información en salud. Santiago. Chile. Julio 14 de 2015


Rompiendo Fronteras
Härtel S.
XVIII Congreso Chileno y II Internacional de Tecnología Médica. Santiago, Chile Julio 15-16 de 2015


Ciencia e Ideología: Discusiones sobre modelos que guían la investigación de algunos fenómenos biólogicos y su impacto social
Härtel S.
Ciencia y Desarrollo en Latinoamérica. Santiago, Chile. Julio 27 de 2015


Nuevas oportunidades de desarrollo abiertas ppr red fotónica de la fibra óptica Austral
Härtel S.
Jornada Tecnológica de Magallanes. Punta Arenas, Chile. Julio 27 de 2015.


Vida ¿una cuestión de grasas?
Härtel S.
Jornada de Discusión: Ciencia y Desarrollo en Latinoamérica. Santiago, Chile. Julio 27 de 2015


El Desarrollo de la Disciplina en el País y la Región
Härtel S.
Primer Simposio Chileno de Informática en Salu. Santiago, Chile. Agosto 17 de 2015


Health Informatics, Biomedical Informatics, Education, Program Development, Capacity Building - Latin America
S. Härtel, M. Cerda, S. de la Fuente, M. Mattoli
EHealth-enabled Health MEDINFO 2015. Sao Paulo, Brasil. Agosto 20 de 2015


10Gbps at the interface of research, development and education in medical informatics
Härtel S.
Fourth CMM Pucón Symposium 2015. Puerto Varas, Chile. Agosto 25 de 2015.


Rutas Redes Relacionales
Härtel S.
Agosto 28 de 2015


El intercambio académico y la incorporación de nuevas tecnologías al quehacer médico y formativo
S. Härtel, M. Mattoli
La docencia hospitalaria. Punta Arenas, Chile. Enero 9 de 2015


Ciencias y Salud: Dos Desafíos Crónicos
Härtel S.
XXI Semana Nacional de la Ciencia y la Tecnología. Santiago, Chile. Mayo 10 de 2015


Fotones que van, fotones que vienen. Microscopía de ayer, hoy y mañana.
Härtel S.
XXI Semana Nacional de la Ciencia y la Tecnología. Santiago, Chile. Julio 10 de 2015


Misión Bioteconlogía en el Sector Salud
Härtel S.
AMCHAM CHILE Washington D.C. Octubre 26 de 2015


Aplicaciones en Biomedicina: Clasificación Genómica Eficiente e Identificación Masiva de Objetos e Imágenes
Assar R., Cerda M., Hitschfeld-Khaler N., Silva J., Castañeda V. y Härtel S. Noviembre 17 de 2015


10Gbps at the interface of research, development and education in medical informatics
Härtel S.
Valparaiso, Chile. Noviembre 20 de 2015


BioMedHPC: Big Data - Connectivity and HPC in Bioimaging, Biomedicine, and Medical Informatics
Härtel S.
Taller Astroingenieria III Taller, Santiago, Chile. Noviembre 23 de 2015.


Informatica Médica en Chile
Härtel S.
Jornada Sidra - Himss Chile Conference and Exhibition. Santiago, Chile. Noviembre 30 de 2015.


10Gbps at the interface of research, development and education in medical informatics
Härtel S.
CMM - Pucón Meeting. Puerto Varas, Pucón, Chile. Diciembre 12 de 2015.


10Gbps at the interface of research, development and education in medical informatics
Härtel S.
REUNA. Santiago, Chile. Diciembre 18 de 2015


The First Chilean Center of Digital Pathology
Härtel S. ,Diaz E.
First Chilean Workshop on Digital Pathology and Virtual Microscopy 2015. Santiago, Chile. Noviembre 6 de 2015


- 2014 -


Computational methods for analysis of cancer cells with overexpression of HER2 protein
Pezoa R., Salinas L., Rojas-Moraleda R., Härtel S.
XIX Congreso de la Sociedad Chilena de Anatomía Patológica. Valdivia, Chile. Noviembre 26 - 28 de 2014


Primer Encuentro Científico BioMed-HPC 2014. Proyectos científicos, necesidades presentes y futuros que definen nuestra futura colaboración, cursos e entrenamiento en HPC
Härtel S.
Director BioMedHPC, Programa de Anatomía y Biología del Desarrollo, Instituto de Neurociencias Biomédicas BNI, Instituto de Ciencias Biomédicas ICBM, Facultad de Medicina, Universidad de Chile. Enero 14 de 2013


A segmentation method for images with subjective contours applied to immunohistochemistry-stained cell membranes
Pezoa R., Rojas-Moraleda R., Salinas L., Härtel S,.
European Congress of Digital Pathology. Paris, Francia. Junio 18 - 21 de 2014


From Microscopy, Imaging to Clinical Research: A Latin American Perspective
García A., Sigle S., Díaz E., Müller B., Härtel S.
12th European Congress on Digital Pathology. Paris, Francia, Junio 18 - 22 de 2014


Structural dynamics of the endoplasmic reticulum and its relation to luminal protein transport
Toledo J., Navarro N., Romero P., Urra F., Cerda M., Santibañez F., Ramirez O., Härtel S.
XXVIII Annual Meeting of the Sociedad de Biología Celular de Chile. Puerto Varas, Chile. Octubre 26-30 de 2014


Innovación tecnológica en la enseñanza superior: Uso de microscopía virtual y guías metodológicas de aprendizaje en carreras de la salud
Diaz E., Härtel S.
Propuesta presentada al Fondo de Investigación en Educación (FONIDE) del Ministerio de Educación.
Santiago, Chile. Octubre 22 de 2014


Big Data, Noisy Data, Dirty Data! Bio-imaging for Science and Society
Härtel S.
Seminario Internacional Ciencia e Ideología: Discusiones sobre modelos que guían la investigación de algunos fenómenos biológicos y su impacto social"
Quito, Ecuador. Julio 9-11 de 2014


Resolución y Super-Resolución. Bases de la Microscopía en Biología Celular
Härtel S.
CEMC- BNI, Santiago, Chile. Marzo 4 de 2014


Whole Slide Imaging (WSI) y Patología Digital Asistida por Internet
García A., Díaz E., Mattoli M., Härtel S.
XIX Congreso de la Sociedad Chilena de Anatomía Patológica. Valdivia, Chile, November 26 - 28 de 2014


Visita a Departamentos de Anatomía Patológica, Altamente Virtualizados
Fernández S., Härtel S.
Hospital Herlev, Rigs Hospitalitet and Aharus Universitary Hospital. Aharus, Dinamarca. Junio 23-24 de 2014


Optics, Forces and Development
Härtel S., Concha M.
International Course Optics, Forces and Development. Biomedical Neuroscience Institute (Chile) and QuanTissue (ESF, Europe). Santiago, Chile. Mayo 5-16 de 2014


Visualisation and Manipulation of Signals and Force in Devolping Tissues
Härtel S., Concha M.
Biomedical Neuroscience Institute (Chile) and QuanTissue (ESF, Europe ). Santiago, Chile. Mayo 5-16 de 2014


BioHPC Medical Informatics and Advanced Imaging at UChile
Härtel S.
ICT / Big Data Workshop (8th AccessNova Forum). Tokyo, Japan. Octubre 6-9 de 2014


Chile-Japan Academic Forum at UTokyo ICT / Big Data Workshop: 8th AccessNova Forum Massive Data in Astronomy
Härtel S.
Eismology, Biomedicine and Mining Hongo Campus, University of Tokyo. Tokyo, Japan. Octubre 6-9 de 2014


- 2013 -


A novel approach for detection and segmentation of human sperm head characteristics
Chang V., Saavedra J., Castañeda V., Sarabia L., Hitschfeld N., Härtel S.
XXIII Reunión de la Asociación Latinoamericana de Investigadores en Reproducción Humana - ALIRH.
Cancún - Quintana Roo, México. Noviembre 11-14 de 2013


Calcium Waves in Hippocampal Neurons and Their Modulation by Endoplasmic Reticulum Organization
Cordova A., Ramírez O., Cerda M., Couve A., Hidalgo C., Härtel S.
XXVII Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile. Puerto Varas, Chile. Octubre 26-30 de 2013


Virtual Microscopy for Professional Development and University Education in Chile
Díaz E., García A., Rojas R. , Henríquez P., Herrera J., Lee K., Grabe N., S Härtel.
3rd European Conference on Whole Slide Imaging and Analysis, Hamamatsu TIGA Center.
University of Heidelberg. Germany. Noviembre 29-30 de 2013


Digital image processing for applications in biomedical diagnosis
García A, Castañeda V, Vargas S, Figueroa C, Rojas R and S Härtel.
XII Congreso Interamericano de Microscopía CIASEM 2013 - Poster Presentation , Cartagena de Indias, Colombia, Septiembre 24-28 de 2013


From Microscopy, Imaging to Clinical Research: A Latin American Perspective
García A., Díaz E., Müller B., Härtel S.
3rd European Conference on Whole Slide Imaging and Analysis, Hamamatsu TIGA Center.
University of Heidelberg, Germany. Noviembre 29-30 de 2013


Big Data for Designing the Future. Forum U Tokyo, Global Emergence of Frontier Knowledge
Härtel S. (speaker)
Santiago, Chile. Noviembre 8 de 2013


Cross Correlation Functions and Partial Differential Equations for the Analysis of Morpho-Topological Microscopy Data
Härtel S.
Universidad de Antioqui, Medellín, Colombia. Septiembre 30 de 2013


Reunión Anual Neuro Sur II - BNI Regional Network
Härtel S.
Buenos Aires, Argentina. Septiembre 2 de 2013


The Computational Pixel Park of Quantitative Fluorescence Microscopy
Härtel S.
Universidad de Antioquia. Medellín, Colombia. Septiembre 30 de 2013


Quality, Quantity, Reproducibility: Biomedical Imaging at the Inter-Face of Research and Development Photons, Borders, Flows
Härtel S., Cerda M., Jara J., Castañeda V.
Third CMM Pucón Symposium. Pucón, Chile. Agosto 20-23 de 2013


Multi scale optical flow for motion analysis of in vivo optical microscopy data
Härtel S., García G.
12th Inter-American Microscopy Congress CIASEM. Cartagena de Indias, Colombia. Septiembre 24-28 de 2013


Gold Standars and expert driven calibrations for digital sperm analysis via internet: Motility, Vitality, DNA Fragmentation
Härtel S., Garcia G., Castañeda V.
XXIII Reunión de la Asociación Latinoamericana de Investigadores en Reproducción Humana. ALIRH, Cancún, Quintana Roo, México. Noviembre 11-14 de 2013


Super-resolution optical fluctuation imaging of GABAB neurotransmitter receptors in hippocampal neurons elucidates intracellular receptor trafficking and assembly
Huss A., Ramírez OA., Santibañez F., Couve A., Härtel S, Enderlein J.
DPG Spring Meeting - Poster communication. Regensburg, Germany. Marzo 10-13 de 2013.


SOFI of GABAB neurotransmitter receptors in hippocampal neurons elucidates intracellular receptor trafficking and assembly
Huss A.
SPIE BiOS, Single Molecule Spectrosco and Superresolution Imaging VI - Oral communication. San Francisco CA, US., Febrero 2-7 de 2013


Subcellular localization and trafficking of GABAB receptor subunits in hippocampal neurons using SOFI super-resolution microscopy
Ramírez OA., Huss A., Santibañez F., Couve A., Enderlein J., Härtel S.
XII Congreso Interamericano de Microscopía - CIASEM, Poster Presentation.
Cartagena de Indias, Colombia. Septiembre 24-28 de 2013


Topological Invariants for Segmentation of Nuclei and Membranes in Breast Cancer Analysis
Rojas-Moraleda R., Pezoa R., Xiong W, Valous N., Diaz E., Cerda M., Garcia A. , Salinas L., Grabe N., Härtel S.
3rd European Conference on Whole Slide Imaging and Analysis, Hamamatsu TIGA Center.
University of Heidelberg, Germany. Noviembre 29-30 de 2013


SOFI of GABAB neurotransmitter receptors in hippocampal neurons elucidates intracellular receptor trafficking and assembly. Proceedings SPIE
Huss A., Ramírez O., Santibáñez F., Couve A.,Härtel S., Enderlein J.


Characterization of the ER-to-Golgi intermediate compartment (ERGIC) in hippocampal neurons
Juricic MA., Cerda M., Cánovas J.A, Kukuljan M., Härtel S., Couve A.
XXVII Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile. Puerto Varas, Chile. Octubre de 2013


Trypanosoma cruzi induces differentiation of the trophoblast
Castillo C., Liempi A., Droguett D., Duaso J., Cerda M., Härtel S., Galanti N., Maya JD., Kemmerling U.
IFPA Meeting 2013. Whistler, Canada. Septiembre 11-14 de 2013


Trypanosoma cruzi induces cellular proliferation in the trophoblastic cell line bewo
Droguett D., Liempi A., Castillo C., Duaso J., Cerda M., Härtel S., Galanti N., Maya JD., Kemmerling U.
IFPA Meeting 2013. Whistler, Canada. Septiembre 11-14 de 2013


Advanced Tools Applied to Frontier Astronomy, BioMedicine and Massive Data-Driven Sciences. Third CMM Pucón Symposium. Pucon, Chile, August 20, 2013
Castañeda V, Cerda M, Jara J and S Härtel,


Determinación de parásitos intracelulares de Trypanosoma cruzi mediante el uso del software Matlab
Liempi A, Castillo C, Duaso J, Droguett J, Galanti N, Härtel S, Cerda M, Kemmerling U. XV Jornadas Anuales de Parasitología, July 24-26, Santiago, Chile, 2013. ("1er Lugar Trabajo Libre")


- 2012 -


Regulation of Neural Crest migration by Notch signalling
Richardson J, Santibañez F, Figueroa C, Härtel S and Linker C. 2nd European Zebrafish PI Meeting, March 21-23, Karlsruhe, Germany, 2012


Migration of Neural Crest regulated by Notch Pathway
Richardson J, Santibañez F, Figueroa C, Härtel S and Linker C. 7th Abercrombie Meeting, November 25-27, Oxford, UK, 2012


Presentación Instituto de Ciencias Biomédicas de la Universidad de Chile
Capacidades de Cómputo para la investigación en Chile. REUNA, Enero 17, Santiago, Chile 2012


Role of Notch signalling during Neural Crest migration
Richardson J, Santibañez F, Figueroa C, Härtel S and Linker C. Developmental Biology Symposium, January 11, CIMARQ, Quintay, Chile, 2012


Skeleton-based in vivo morphological analysis of axonal projections in single-labelled parapineal neurons during zebrafish development.
Palma K, Armijo, L, Meynard M, Guerrero N, Santibañez F, Härtel S and M Concha.
VI International Meeting of the Latin American Society for Developmental Biology. Montevideo, Uruguay, 26-29 April


Defining metrics to compare skeleton methods applied to biological structures.
Villarroel S, Cerda M, Santibañez F, Ramírez O, Palma K, Concha M, Hitschfeld-Kahler N, Härtel S.
XXVI Annual Meeting of the Sociedad de Biología Celular de Chile, Pto Varas, Chile. Poster presentation


- 2011 -


Tissue Dynamics and Cellular Rosette Formation During Morphogenesis of the Zebrafish Laterality Organ
Pulgar E, Santibañez F, Figueroa R, Steinfeld J, Briones L, Härtel S, Concha M. XXV Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile. Puerto Varas, Chile 1-5 November, 2011


Neuronal endoplasmic reticulum (ER) imaging with super-resolution optical fluctuation imaging (SOFI)
Omar Ramírez, Felipe Santibáñez, Dirk Haehnel, Andrés Couve, Jörg Enderlein & Steffen Härtel. XXV Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile. Puerto Varas, Chile 1-5 November, 2011


Model systems for accuracy testing of skeleton methods for biological structures
Alcayaga L, Santibáñez F, Ramírez O, Palma K, Jara J, Concha M, Hitschfeld N and Härtel S. XXV Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile. Puerto Varas, Chile 1-5 November, 2011


Neuronal endoplasmic reticulum organization and modulation of calcium signals
Figueroa C, San Martín C, Couve A, Härtel S, Ramírez O. XXV Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile. Puerto Varas, Chile 1-5 November, 2011


Quantification of actcive organization and diffusion within the endoplasmic reticulum
Briones L, Ramírez O, Scheer J, Moraga H, Jara J, Osorio-Reich M, Asahi T, Ortega J, Couve A, and Härtel S. XXV Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile. Puerto Varas, Chile 1-5 November, 2011


Unraveling the Mysteries of Superresolution Optical Fluctuation Imaging (SOFI)
Felipe Santibáñez, Omar Ramírez, Dirk Haehnel, Jörg Enderlein & Steffen Härtel. XXV Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile. Puerto Varas, Chile 1-5 November, 2011


Tissue Dynamics and Cellular Rosette Formation During Morphogenesis of the Zebrafish Laterality Organ
Pulgar E, Santibañez F, Figueroa R, Steinfeld J, Briones L, Härtel S, Concha M. The 26th European Cytoskeletal Forum (ECF) Meeting, Stress-Lake Maggiore, Italy, October 29 - November 2, 2011


Estandarización de concentración, recuento de células redondas y motilidad mediante espermiograma digital
Acuña AI, García A,Figueroa C, Scheer J, Vargas S, Osorio-Reich M,Horta F, Rojas R, Rojas N, Sarabia L, Madariaga M,Smith R, Härtel S. XXII Reunión Bienal de la Asociación Latinoamericana de Investigadores en Reproducción Humana. Panama, Ciudad de Panamá, Octubre 13-14, 2011


Estandarización de vitalidad y fragmentación ADN en el espermiograma digital
García A, Acuña AI, Figueroa C, Scheer J, Vargas S, Osorio-Reich M, Rojas R, Rojas N, Sarabia L, Madariaga M, Acosta A, Crosby J,Smith R, Härtel S. XXII Reunión Bienal de la Asociación Latinoamericana de Investigadores en Reproducción Humana. Panama, Ciudad de Panamá, Octubre 13-14, 2011


Espermiogramas digitales asistidos por Internet.
Härtel S. Segundo Workshop Teórico Práctico de Expertos Latinoamericanos para la Estandarización del análisis seminal (PLEAS). Panama, Ciudad de Panamá, Octubre 11-12, 2011


Adhesive Forces and Tensile Properties Underlie the Formation of Early Cellular Rosettes During Epithelial Organogenesis in Zebrafish
Pulgar E, Oteíza P, Köppen M, Krieg M, Santibañez F, Steinfeld J, Figueroa R, Briones L, Härtel S, Heisenberg CP, Concha M. III School on Optics and Photonics, Concepción, Chile Octubre 3-7, 2011


Quantification of IHC-stained Tissue Images Using Support Vector Machine (SVM)
R. Rojas Moraleda, R. Pezoa Rivera, L. Salinas Carrasco, J. Reyes Lopez, L. Pizarro Cortez, R. Gonzalez Alvarez. Congress 12 th International Conference on Systems Biology (ICSB). Mannheim, Germany, 28 Agosto -1 Setiember, 2011


Performance of optical flow techniques for motion analysis of fluorescent point signals in confocal microscopy
J. Scheer, J. Jara, O. Ramírez, J. Delpiano, J. Ruizdelsolar, E. Pulgar, K. Palma, C. Lemus, M. Concha, S. Härtel. Congress 12 th International Conference on Systems Biology (ICSB). Mannheim, Germany, 28 Agosto -1 Setiember, 2011


Digital Imaging Processing for Semen Analysis
A.Garcia, S.Vargas,M Osorio -Reich, H.Moraga, J.Jara, A.Acuña, C.Figueroa, L.Sarabia, J. Scheer, A.Acosta, J.Crosby, M.Madariaga, R.Rojas, R.Smith, S.Härtel. Congress 12 th International Conference on Systems Biology (ICSB). Mannheim, Germany, 28 Agosto -1 Setiember, 2011


Skeleton-curves: Implementation and Extraction of Morph-topological Features of Biological Structures from 3D Microscopic Image Sets
F. Santibáñez-Leal, L. Alcayaga, J. Jara, o. ramirez, k. palma, M. Concha, N. Hitschfeld-Kahler, S. hartel. Congress 12 th International Conference on Systems Biology (ICSB). Mannheim, Germany, 28 Agosto -1 Setiember, 2011


Temporal Cell-cell Dynamics in Microscopy Image Series
Jara J, Scheer J, Lemus C, Palma K, Pulgar E, Reig G, Figueroa C, Briones L, Concha M, Hitschfeld N, Härtel S. Congress 12 th International Conference on Systems Biology (ICSB). Mannheim, Germany, 28 Agosto -1 Setiember, 2011


Advanced Mathematical Tools for Frontier Astronomy and other Massive Data-driven Sciences
Härtel S. Pucón Symposium: Pucón, Chile, 16-19 Agust, 2011


Modulation of endoplasmic reticulum structure and function in neurons
O. Ramirez, M. Jaureguiberry, M. Osorio-Reich, T. Asahi, J. Ortega, A. Couve & S. Härtel.8th Ibro Wordld Congress of Neurocience International Brain Reserch. Florencia, Italy, July 14, 2011


Informática Medica: Red para una Investigación y Docencia Innovadora
De la Fuente S, Santibañez F, Dickhaus H, Metzner R, Karch Dominik y Härtel S Guadarajara, Jalisco, México, 19 de Mayo, 2011


Morphological reorganization of the ER in dendrites
Ramirez O. NEMO Sientific Network (NSN) Symposium Advanced Microscopy and Image Processing in Neurobiology. Santiago, 17-18Enero, 2011


Image processing routines for the quantification of morpho-topological features of biological objects from fluorescence microscopy data
Härtel S. NEMO Sientific Network (NSN) Symposium Advanced Microscopy and Image Processing in Neurobiology. Santiago, 17-18 Enero, 2011


- 2010 -


Hierro y Oligómeros del Péptido Amiloide Estimulan la Fisión Mitocondrial Aumentando la Liberación de Calcio Mediada por Receptores de Rianodina
Lima C, Härtel S, Garcia A, Nuñez M, Hidalgo C. LIII Reunión Anual de la Sociedad de Biología de Chile. Noviembre 21-24, La Serena, Chile, 2010


Partial differential equations and cross correlation functions for the study biological features in microscopic images
Härtel S. LIII Reunión Anual de la Sociedad de Biología de Chile. Noviembre 21-24, La Serena, Chile 2010


Grading motility in Human Sperm by an unsupervised machine learning approach
Rojas R, Vargas S, Osorio-Reich M, Garcia A, Härtel S. XXIX International Conference of the Chilean Computer Society, II Chilean Workshop on Pattern Recognition. Noviembre 15-19, Antofagasta, Chile 2010


Role of Adhesion during Epiboly in Annual Fish. Biological Research
Reig G, Figueroa C, Larenas V, Härtel S, Concha M. V International Meeting of the Latin American Society for Developmenta. 11-19 Noviembre, Santa Cruz, Chile 2010


Morphogenesis of the Parapineal Nucleus in Zebrafish. Biological Research
Lemus C, Palma K, Colombo A, Armijo L, Härtel S, Concha M. V International Meeting of the Latin American Society for Developmenta. 11-19 Noviembre, Snata Cruz, Chile 2010


Dynamic Analysis of Cellular Rosettes during formation of the Zebrafish Laterality Organ
Pulgar E, Oteíza P, Köppen M, Krieg M, Steinfeld J, Härtel S, Heisenberg C, Concha M. V International Meeting of the Latin American Society for Developmenta. 11-19 Noviembre, Snata Cruz, Chile 2010


Modelos geométricos y análisis de imágenes biológicas 3D: un caso de aplicación
Jara J, Aguilar P, Figueroa C, Reig G, Concha M, Hitschfeld N, Härtel S.
XXIX International Conference of the Chilean Computer Society, II Chilean Workshop on Pattern Recognition. Noviembre 15-19, Antofagasta, Chile 2010


Skeletons and their Application to Quantify tree-like Biological Structures
Aguilar P, Jara J, Ramirez O, Palma K, Concha M, Hitschfeld N, Härtel S.
XXIV Annual Meeting Chilean Society for Cell Biology. November 1-5, Pucon, Chile 2010


Computer Assisted Analysis of Cell Morpho-Topology During Epiboly in Annual Fish
Figueroa C, Reig G, Jara J, Osorio M, Concha M, Härtel S.
XXIV Annual Meeting Chilean Society for Cell Biology. November 1-5, Pucon, Chile 2010


Structure and Dynamic Softhe Endoplasmic Reticulum: A Quest for Quantitative Parameter
Ramirez O, Jara J, Aguilera P, Del Piano J, Jaureguiberry M, Couve A, Härtel S.
XXIV Annual Meeting Chilean Society for Cell Biology. November 1-5, Pucon, Chile 2010


The Endoplasmic Reticulum and Kif5 Constitute a Dendritic Transport System for Gaba R1
Rodriguez J, Ramirez O, Jaugueriberry M, Härtel S, Couve A.
XXIV Annual Meeting Chilean Society for Cell Biology. November 1-5, Pucon, Chile 2010


Computational Analysis Segmentation and Description of Biological Structure in Microscopy Images
Jara J, Härtel S.
XXIV Annual Meeting Chilean Society for Cell Biology. November 1-5, Pucon, Chile 2010


Caveolin1 Enhances Focal Adhesion Turnover and Migration of Metastatic Cancer Cells
Torres V, Urra H, Ortiz R, Lobos L, Diaz M, Diaz N, Härtel S, Leyton L, Quest A.
XXIV Annual Meeting Chilean Society for Cell Biology. November 1-5, Pucon, Chile 2010


Sistema Digital Automatizado para Estandarizar el Espermiograma
Garcia A, Vargas S, Osorio-Reich M, Moraga H, Sarabia S, Madariaga M, Acosta A, Crosby J, Smith R y Härtel S.
XXI Reunión Anual Sociedad Chilena de Reproducción y Desarrollo. La Serena. September 1-4, 2010


Confined Displacement Algorithm and Local Colocalization Indices for the Quantification of Colocalizing Structures in Fluorescence Microscopy
Ramirez O, Garcia A, Osorio-Reich M, Espinosa D, De la Fuente S and Härtel S.
2nd European Workshop on Tissue Imaging and Analysis. Heidelberg, Germany, June 25-26, 2010


Morpho-topological Analysis of Cell and Tissue Reorganisation in Teleost Fish Embryos
Reig H, Figreroa C, Härtel S & Concha M.
2nd European Workshop on Tissue Imaging and Analysis, BIOQUANT, Heidelberg, Germany, June 25-26, 2010


Espermiogramas Digitales Asistidos Por Internet (ED�AI)
Steffen Härtel.
PLEAS- OMS: Primer Workshop de Expertos Latinoamericanos para la Estandarización del Análisis Seminal, Santiago, Chile, May 5-7, 2010


- 2009 -


Defined Displacement Algorithms and Local Colocalization Indices and Quantify Colocalization of Point Sources in Confocal Microscopy
Alejandra Garcia and Steffen Härtel
11th International Conference on Methods and Applications of Fluorescence: Spectroscopy, Imaging and Probes, Budapest, Hungary, September 6-9, 2009
Show Abstract 


Adjacent Active Surface Models for improved quantification of morpho-topological properties of fluorescent membrane surface pattern of Giant Unilamellar Vesicles and N-cadherin-expression during epithelial morphogenesis
Cristina Mello, Pablo Oteíza, Peter Husen, Carmen Lemus, Luis Bagatolli, Felipe Olmos, Alejandra Garcia, Miguel Concha and Steffen Härtel
11th International Conference on Methods and Applications of Fluorescence: Spectroscopy, Imaging and Probes, Budapest, Hungary, September 6-9, 2009
Show Abstract 


Insulin Resistant Skeletal Muscle: Mitochondria Structure, Dynamics And Calcium Homeostasis
Eisner, García, Härtel, Escobar, Casas, Aedo, Mears, Ezquer, Conget, Lavandero, Hidalgo, Jaimovich
53th Annual Meeting of the Biophysical Society, 17th IUPAB International Biophysics Congress. February 28 March 4, Boston, MS, USA
Download PDF   | Show Abstract 


Lipid Domains In Giant Vesicles Composed Of Ternary Lipid Mixtures Containing Cholesterol And Their Relationship With Thermodynamic Phases
LR. Arriaga, J. Ipsen, A. Garcia, S. Härtel, F. Monroy and L.A. Bagatolli
53th Annual Meeting of the Biophysical Society, 17th IUPAB International Biophysics Congress. February 28 March 4, Boston, MS, USA
Download PDF   | Show Abstract 


- 2008 -


Defined Displacement Algorithms in Combination with Robust Segmentation Procedures Create Structure Sensitive Random Scenarios for Statistical Evaluation of Colocalization in Confined Cellular Compartments
Härtel S, Ramirez O, Garcia A, Espinosa A, Eisner V, Rojas R & A Couve
XXII Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile, October5-8 2008
Show Abstract 


Local Colocalization Indices in Combination with Defined Displacement Algorithms Quantify Colocalization of Point Sources in Confocal Microscopy
Garcia AA, Ramirez O, Couve A, Espinosa A, Eisner V, Jaimovich E, & S Härtel
XXII Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile, October5-8 2008
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Distribución intracelular diferencial de las subunidades del receptor GABAB en dendritas y axones de neuronas hipocampales (Differential intracellular distribution of GABAB receptor subunits in dendrites and axons of hippocampal neurons)
Omar Ramírez, René Vidal, Judith Tello, Karina Vargas, Stefan Kindler, Steffen Härtel y Andrés Couve
XXII Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile, October5-8 2008
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Reorganización supra-celular en forma de roseta anticipa la migración asimétrica del órgano parapineal en pez cebra (Supra-cellular organisation in a rosette-like structure precedes asymmetric migration of the parapineal organ in zebrafish)
Palma K., Lemus C.G., Härtel S., Concha, M.L.
XXII Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile, October5-8 2008
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Lateralización del volumen habenular en humanos: ¿Un caso de dimorfismo sexual? (Habenular lateralisation in humans: a case of sexual dimorphism?)
Bravo D, Díaz E, Härtel S, Concha M
XXII Reunión Anual de la Sociedad de Biología Celular de Chile, October5-8 2008.
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Defined Displacement Algorithms in Combination with Robust Segmentation Procedures Create Structure Sensitive Random Scenarios for Statistical Evaluation of Colocalization in Confined Cellular Compartments
Härtel S, Ramirez O, Garcia A, Espinosa A, Eisner V, Rojas R & A Couve
I Congresso IBRO/LARC De Neurociências Da América Latina, Caribe E Península Ibérica, Buzios, RJ, Brasil, September 1-4 2008
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Local Colocalization Indices in Combination with Defined Displacement Algorithms Quantify Colocalization of Point Sources in Confocal Microscopy
Garcia AA, Ramirez O, Couve A, Espinosa A, Eisner V, Jaimovich E, & S Härte
I Congresso IBRO/LARC De Neurociências Da América Latina, Caribe E Península Ibérica, Buzios, RJ, Brasil, September 1-4 2008
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3d-Visualization And Analysis Of Morpho-Topological Features During Cell Migration And Its Implication In Biomedical Research In Fish Embryos
S Härtel, C Lemus, K Palma, F Olmos, L Pereiro, G Reig, A Catenaccio, P Ruiz, L Muñoz, A Garcia, V Eisner & M Concha
SIAM Conference on Imaging Science, San Diego, USA, July 7-9
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Time Resolved Image Processing Routines For 3d-Visualization And Analysis Of Morpho-Topological Features In Biological And Medical Sciences.
Steffen Härtel, C. Lemus, K Palma, A Garcia, R. Rojas, L. Munoz, R. Rojas, M Concha
Fifth AccessNova Forum: Ubiquitous Networks for New Advanced Applications, Pucón, Chile, May 19-22
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Mitochondrial Fission During Ceramide-Induced Cardiac Myocyte Apoptosis Early Steps
VS. Eisner, V. Parra, M. Chiong, F. Moraga, A. Criollo, A. Garcia, S. Härtel, E. Jaimovich, A. Zorzano, C. Hidalgo, S. Lavandero.
52th Annual Meeting of the Biophysical Society, 16th IUPAB International Biophysics Congress. February 3-7, Long Beach, Ca, USA
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Do GUVs composed of binary lipid mixtures obey the lever rule? A quantitative microscopy imaging approach
M. Fidorra, S. Härtel, A. Garcia, J. H. Ipsen, & L.A. Bagatolli.
52th Annual Meeting of the Biophysical Society, 16th IUPAB International Biophysics Congress. February 3-7, Long Beach, Ca, USA
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3D Morpho-topological Analysis of Asymmetric Neuronal Morphogenesis in the Embryonic Zebrafish Brain
Härtel S, Lemus CG, Palma K, Cabrejos M & Concha M
From Developmental Biology To Tissue Regeneration, January 08-11, Santiago, Chile
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Cell Sorting During Early Development Of Annual Fish.
Reig H., Härtel S., & Concha M.L.
From Developmental Biology To Tissue Regeneration, January 08-11, Santiago, Chile.
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- 2007 -


Scaling Indices in Combination with Defined Displacement Algorithms Quantify Colocalization of Subcellular Structures in Fluorescence Microscopy.
Índices de Escalamiento en Combinación con Algoritmos de Desplazamiento Cuantifican la Colocalización de Estructuras Subcelulares mediante Microscopía de Fluorescencia.
Härtel S, Ramirez O, Couve A, Espinosa M, Villalon M, Best C & Räth C
XXI Reunión Anual, Sociedad de Biología Celular de Chile, October 07-10, Pucon, Chile.
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Quantitative analysis of cellular compaction during gastrulation in Cynolebias and asymmetric morphogenesis of the parapineal organ in Danio rerio.
Análisis cuantitativo de compactación celular durante la gastrulación en Cynolebias y la morfogénesis asimétrica del órgano parapineal en Danio rerio.
Covacevich Y, Pereiro, L, Lemus CG, Concha ML, Härtel S
XXI Reunión Anual, Sociedad de Biología Celular de Chile, October 07-10, Pucon, Chile.
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Prevalecia de monómeros de las subunidades del receptor GABAB en dendritas y axones de neuronas hipocampales.
Prevalence of monomeric GABAB receptor subunits in dendrites and axons of hippocampal neurons.
Ramírez O, Vidal R, Tello J, Härtel S & A Couve
XXI Reunión Anual, Sociedad de Biología Celular de Chile, October 07-10, Pucon, Chile.
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Analysis of asymmetric parapineal morphogenesis at supra-cellular, cellular, and sub-cellular levels in zebrafish.
Concha M, Lemus CG & Hartel S
5th European Zebrafish Genetics and Development Meeting. 12-15 July, Amsterdam, Netherlands.


Asymmetric morphogenesis of the parapineal organ in the developing zebrafish brain.
Concha M, Lemus C, Hartel S, Regan J, Russel C, Cabrejos SW & Wilson SW
First Pan American Congress in Developmental Biology, 16-20 June, Cancun, Mexico.


3D-Visualization and Analysis of Morpho-Topological Parameters for the Quantification of Asymmetry During Neural Development and Lipid Phase Formation in Giant Unilamellar Liposomes.
Steffen Härtel, Carmen Lemus, Karina Palma, Matthias Fidorra, Alejandra Garcia, Luis Bagatolli, Miguel Concha
6th international conference of biological physics | 5th southern cone biophysics congress. 27-31 August, Montevideo, Uruguay.
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- 2006 -


Local Scaling Indices for the Quantification of Colocalization in Confocal Microscopy.
Härtel, S., Ramirez, O., Couve, A., Best, C., Räth C.
Vision by Brains and Machines, 13-17 November, Montevideo, Uruguay.
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3D Morpho-Topological Analysis of Asymmetric Neuronal Morphogenesis in Developing Zebrafish.
S. Härtel, J. Jara, C.G. Lemus, M.L. Concha
CompIMAGE
Computational Modelling of Objects Represented in Images,
20-21 October, Coimbra, Portugal.
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Multi-scale analysis of the asymmetric morphogenesis of the parapineal organ in zebrafish.
Análisis de la morfogénesis asimétrica del órgano parapineal del pez cebra en tres niveles de organización.
Härtel S., Lemus C.G., Jara J., Cabrejos M.E., Concha M.L.
XX Reunión Anual, Sociedad de Biología Celular de Chile, October 08-11, Pucon, Chile.
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FRET revela la Cinética de la Hidrólisis de PIP2 en la Membrana Plasmática de Células Musculares Esqueléticas después de la Estimulación Eléctrica.
García A, Härtel S, Müller M, Eltit JM, y Jaimovich E
XX Reunión Anual, Sociedad de Biología Celular de Chile, October 08-11, Pucon, Chile.
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Localización subcelular y función del receptor GABAB en neuronas hipocampales en cultivo.
Ramírez, O., Härtel S. & Couve A.
XX Reunión Anual, Sociedad de Biología Celular de Chile, October 08-11, Pucon, Chile.
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Sphingomyelinase-induced nonequilibrium phenomena in biointerfaces.
Fanani L., Härtel S., Jara J. & Maggio B.
VI Congreso Iberoamericano de Biofísica 2006, 24-27 September, Madrid, España.
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Cell sorting during early development of annual fish.
(Segregación celular durante el desarrollo temprano de peces anuales)
Reig G., Härtel S. y Concha M.
XVII Reunión Anual de la Sociedad Chilena de Reproducción y Desarollo, 10-12 August, Reñaca, Chile.
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Morphological and Volumetric Analysis of the Human Habenulae.
Díaz E., Bravo D., Härtel S., Villalón A., Cifuentes D., Célis M. & Concha M.L.
II Congreso de la Sociedad Chilena de Neurociencia, 27-29 September, Curicó, Chile.
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Asymmetric morphogenesis of the parapineal organ in the fish brain.
Concha, M., ...
Left-Right Asymmetry Mini-Symposium, May 15, RIKEN, Brain Research Institute, Japan.
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Society for Industrial and Applied Mathematics (SIAM)
Conference on Imaging Science, May 15�17, Minneapolis, MN, USA.


The Quinoa: cultivating the desert with sea water.
Galleguillos , J., Orellana , L., Arredondo , V., Vega, P., Medel , M., & S. Härtel
International Science and Engineering Fair, May 7�13, Indianapolis, Indiana, USA.
Poster:   Press:  


Effects of drought stress on growth and nutrition of two species of Nothofagus ectomycorrhizal fungi.
Alvarez, M., Saavedra, I., Alberdi, M., Godoy, R., Valenzuela, E. & S. Härtel
XVII Reunión de la Sociedad de Botánica de Chile, January 16-20, Talca, Chile.


Time resolved image processing routines for the study of membrane related processes with fluorescence microscopy.
Steffen Härtel, Jorge Jara & Felipe Barros
13th International Symposium on Chromaffin Cell Biology, January 7-12, Pucón, Chile.
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- 2005 -


Scaling Index Methods for Colocalization Analysis of Biological Structures.
Härtel S.
BIOMAT VI, 6° Encuentro Chileno de Biomatemática, 19 y 20 de Diciembre, Valdivia, Chile.
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Contornos Activos y Flujo de Vectores de Gradientes Generalizados: Modelos Deformables para la Segmentación y Parametrización de Estructuras Biológicas.
Jara J. & Härtel S.
BIOMAT VI, 6° Encuentro Chileno de Biomatemática, 19 y 20 de Diciembre, Valdivia, Chile.
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Cross Correlation and Scaling Index Methods for the Automated Quantification of Colocalization in Fluorescence Microscopy.
Härtel, S., Cornejo, I., Rojas, R., & Barros, L.F.
XIX Reunión anual, Sociedad de Biología Celular de Chile, October 17-21, Pucon, Chile.
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Asymmetric morphogenesis of the parapineal organ in the embryonic zebrafish brain.
Cabrejos, M.E., Lemus, C.G., Härtel, S. & M.L. Concha
XIX Reunión anual, Sociedad de Biología Celular de Chile, October 17-21, Pucon, Chile.


Scaling Index Methods for the Quantification of Colocalization in Fluorescence Microscopy.
Härtel S. & Cornejo I.
XV. International Biophysical Congress, August 27 - September 1, Montpellier, France.
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Active Contours Quantify Shape Transitions and Multi-Scale Organization of Sphingomyelinase Generated Ceramide-Enriched Domains in Lipid Monolayers.
Härtel, S., Fanani, L., Jara, J., & B. Maggio.
Physics of Life: Dynamics of single molecules and dynamics of biological networks, August 21-27, Humlebæk, Denmark.
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Computational Quantification of the Formation of Shape Transitions and Multi-Scale Organization of Sphingomyelinase Generated Ceramide-Enriched Domains.
Steffen Härtel, María Laura Fanani & Bruno Maggio
Third International Symposium on Computational Cell-Biology, March 19-23, Lenox, MA USA.
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Representation of biological objects in modern microscopy: The Deconvolution Zoo.
Härtel S.
BIOMAT V, 5° Encuentro Chileno de Biomatemática, 13y 14 de Enero, Valdivia, Chile.


- 2004 -


Deconvolution of Microscopal Data for Time Resolved 3-Dimensional Image Processing for the Study of Membrane Related Processes in Cell Biology.
Härtel, S., Verdugo, E., Alvarez, M., Montenegro, C., Niemeyer, M.I., Fanani, M., & L.F. Barros
Representation of reality by brain and machines. Crossed views from neurosciences and computer vision, November 8-12, Montevideo, Uruguay.
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Identification and Classification of Di- and Triploid Erythrocytes by Multi-parameter Image Analysis: A New Method for the Quantification of Triploidization Rates in Rainbow Trout.
Rojas, R., Guarda, M.I., & S. Härtel
Representation of reality by brain and machines. Crossed views from neurosciences and computer vision, November 8-12, Montevideo, Uruguay.
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... to be continued ...






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